Les Cellules et leur Environnement : Dynamique des Interactions (CEDI)

Coordinateur : Bernard MIGNOTTE - Coordinatrice adjointe : Sophie THENET

Les équipes qui composent le GRET CEDI étudient les mécanismes d’interaction des cellules entre elles et avec leur environnement dans différents contextes physiologiques (homéostasie tissulaire, différenciation, immunité) ou pathologiques (maladies infectieuses, maladies métaboliques ou inflammatoires, maladies neurodégénératives, cancer). D'une part, nous nous intéressons à ces questions sous l'angle de leur contrôle génétique et, d'autre part, nous étudions les voies de signalisation et les mécanismes effecteurs impliqués dans les réponses cellulaires. Au-delà de l'intérêt fondamental des questions abordées pour la compréhension des mécanismes de régulation et de leurs dérèglements dans les pathologies, la perspective, à long terme, est de contribuer à l'identification de nouvelles cibles et approches thérapeutiques.

Grands domaines : Adhérence cellulaire, Effets biologiques des champs magnétiques et électromagnétiques, Homéostasie tissulaire, Immunité innée, Ingénierie tissulaire, Interactions virus-hôte, Métabolisme, Mort cellulaire, Physiologie et Physiopathologie, Signalisation cellulaire.

Modèles : Modèles cellulaires, Modèles rongeurs, Modèle drosophile, Modèle poisson, Modèle amphibien, Modèle reptile, Biopsies humaines, Cultures de tissus « ex-vivo ».

Objets d'études : Barrière intestinale, Gouttelettes lipidiques, Jonctions intercellulaires, Matrice extra cellulaire, Mitochondries, Oncogènes et gènes oncosuppresseurs, Polymères naturels, Protéome, Transcriptome, Virus.

Présentation de l'activité scientifique

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Les axes de recherche développés dans le GRET sont centrés sur l’étude des réponses cellulaires à différents agents environnementaux ou micro-environnementaux. Ces agents peuvent être de nature biologique. Il s'agit dans ce cas d'étudier les processus cellulaires mis en œuvre en réponse aux interactions entre la cellule et les autres cellules du tissu, la matrice extracellulaire, des microorganismes pathogènes (bactéries, virus) ou non (microbiote), ou avec leurs métabolites, les facteurs de croissance ou d'inhibition de croissance, les biomatériaux ou les nutriments. Un autre aspect de nos activités concerne les réponses aux agents physiques (champs électromagnétiques, matériaux) ou chimiques (médicaments, drogues, polymères synthétiques). Nous développons pour cela des approches complémentaires à différentes échelles (moléculaire, cellulaire, tissulaire, organisme entier ou inter-organismes (hôte/pathogènes)) en profitant des avantages spécifiques de plusieurs modèles biologiques : cellules en culture bi- ou tri-dimensionnelle, organismes modèles ou d'intérêt (vertébrés et invertébrés), accès à des tissus ou des sérums humains, virus.

Les champs thématiques du GRET attirent un grand nombre d’étudiants effectuant leurs travaux de recherche dans les domaines fondamentaux de la biologie cellulaire et moléculaire, de la génétique, de l’infectiologie, de la physiologie et de la physiopathologie, mais également dans des domaines plus appliqués (sciences du médicament et développement de thérapies antivirales). Ainsi, nous développons une importante activité d'encadrement pédagogique, tant au Master BSE SSIB qu’au Diplôme de l’EPHE en SVT. Le GRET CEDI porte ou participe à plus d’une vingtaine d’UEs (niveau Master), permettant à un grand nombre d’étudiants d’acquérir, comprendre et maîtriser les connaissances inhérentes à nos axes de recherche. Nos domaines d’intérêts nous amènent naturellement à avoir de fortes interactions, à la fois dans nos activités de recherche et d’enseignement, avec plusieurs GRET au sein de l’EPHE (en particulier les GRETs "Génomes, Cancers et Thérapies" et "Approches translationnelles des maladies neurodégénératives").

Localement, nos équipes sont également impliquées dans des programmes de recherche en collaboration avec des laboratoires appartenant à des établissements membres de PSL (Institut Curie, Institut Pasteur). Les enseignants-chercheurs du GRET sont aussi amenés à assurer l’encadrement pédagogique d'étudiants effectuant leurs travaux de recherche dans ces laboratoires.

Personnels EPHE

Nom Fonction Unité de recherche Localisation
Frédérick ARNAUD Directeur d'études cumulant UMR 754 Infections Virales et Pathologie Comparée (IVPC) Lyon cedex 07 69366
Emmanuel BELAMIE Directeur d'études UMR 5253 Institut Charles Gerhardt Montpellier (ICGM) Montpellier 34090
Jade BERTHELOT Ingénieur d'études UMR 5253 Institut Charles Gerhardt Montpellier (ICGM) Montpellier 34090
Michèle CHABERT Maître de conférences UMR_S 1138 Centre de Recherche des Cordeliers (CRC) Paris 75006
Jessie COLIN Maître de conférences EA 4589 Laboratoire de Génétique et Biologie Cellulaire (LGBC) Montigny-le-Bretonneux 78180
Naïma COMUCE Personnel ITRF en appui à la recherche UMR_S 1138 Centre de Recherche des Cordeliers (CRC) Paris 75006
Sylvie DEMIGNOT Directeur d'études UMR_S 1138 Centre de Recherche des Cordeliers (CRC) Paris 75006
Thierry DUPRESSOIR Directeur d'études UMR 1333 Diversité, Génomes et Interactions Microorganismes-Insectes (DGIMI) Montpellier cedex 5 34095
Jean-Marie EXBRAYAT Directeur d'études cumulant UMRS 449 Laboratoire de Biologie générale Lyon cedex 02 69288
Marie-Noëlle LABOUR Maître de conférences UMR 5253 Institut Charles Gerhardt Montpellier (ICGM) Montpellier 34090
Isabelle LAGROYE Directeur d'études UMR 5218 Laboratoire de l'Intégration, du Matériau au Système (IMS) Talence 33405
Ingrid LEMA Attaché(e) temporaire d'enseignement et de recherche UMR_S 1138 Centre de Recherche des Cordeliers (CRC) Paris 75006
Bernard MIGNOTTE Directeur d'études cumulant EA 4589 Laboratoire de Génétique et Biologie Cellulaire (LGBC) Montigny-le-Bretonneux 78180
Maxime RATINIER Maître de conférences UMR 754 Infections Virales et Pathologie Comparée (IVPC) Lyon cedex 07 69366
Malvina SCHATZ Attaché(e) temporaire d'enseignement et de recherche UMR 1333 Diversité, Génomes et Interactions Microorganismes-Insectes (DGIMI) Montpellier cedex 5 34095
Sophie THENET Directeur d'études UMR_S 1138 Centre de Recherche des Cordeliers (CRC) Paris 75006
Barbara VIGINIER - MONOURY Personnel ITRF en appui à la recherche UMR 754 Infections Virales et Pathologie Comparée (IVPC) Lyon cedex 07 69366
Margaux WIECKOWSKI Technicien de laboratoire UMR_S 1138 Centre de Recherche des Cordeliers (CRC) Paris 75006