Microbiologie évolutive et génomique

Cette UE présente un ensemble d'outils et de thématiques qui gravitent autour de la phyloépidémiologie et la génomique des populations de divers agents pathogènes. Nous aborderons aux travers de cours magistraux l'échappement aux antibiotiques, le rôle de la recombinaison chez Escherichia coli, l'utilisation de bactéries comme traceurs des migrations humaines, ainsi que l'évolution expérimentale. Un intérêt tout particulier sera porté sur l'émergence et la ré-émergence de certaines maladies, comme la tuberculose, la peste ou certains virus hémorragiques. Des séances de TD informatique permettront aux étudiants d'appréhender des champs disciplinaires en vogue, comme la modélisation des pandémies, la métagénomique appliquée au champ médical mais aussi aux massifs coralliens, alliant ainsi une formation théorique et pratique dans un même cursus.

Intervenants : Céline BON (Musée de l'Homme), Hervé BLOTTIERE (INRA), Pierre DE VILLEMEREUIL (EPHE-PSL), Olivier GASCUEL (CNRS),Thierry WIRTH (EPHE-PSL)