Jean-Michel Mouton, ancien élève de l'Institut français du Proche-Orient au Caire, est un spécialiste de l'histoire et de l'archéologie du Proche-Orient médiéval, plus particulièrement de la période ayyoubide en Égypte et en Syrie.

Il travaille sur les fortifications médiévales et a dirigé plusieurs chantiers de fouilles en Égypte, Libye, Syrie et Liban.

Il poursuit également, dans le domaine de la papyrologie arabe, la publication de documents qui étaient conservés dans la grande mosquée de Damas à l'époque des croisades.

Publication de la collection dite des « Papiers de Damas » découverte lors de l'incendie de la grande mosquée de Damas en 1893 et conservée depuis 1912 à Istanbul.

Ce programme commencé dans les années 1960 par Janine et Dominique Sourdel est poursuivi par Jean-Michel Mouton et porte sur la publication de plusieurs centaines de documents sur papier datant pour l'essentiel des XII^e et XIII^e siècles et traitant des pèlerinages, des mariages, des actes d'achat et de vente, des requêtes et de la correspondance des habitants de Damas au temps des croisades.